Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms