Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms