Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RIMS3Q9UJD0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RIMS3Q9UJD0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RIMS3Q9UJD0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RIMS3Q9UJD0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIMS3Q9UJD0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIMS3Q9UJD0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIMS3Q9UJD0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RIMS3Q9UJD0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIMS3Q9UJD0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIMS3Q9UJD0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIMS3Q9UJD0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIMS3Q9UJD0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIMS3Q9UJD0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIMS3Q9UJD0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIMS3Q9UJD0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms