Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms