Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms