Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms