Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPN3Q9UHW5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPN3Q9UHW5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms