Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms