Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms