Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms