Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS0

RPS6KB2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB2Q9UBS0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPS6KB2Q9UBS0 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KB2Q9UBS0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms