Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
XCL2Q9UBD3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
XCL2Q9UBD3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms