Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL13Q9P2N7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms