Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL42Q9P2K6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms