Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms