Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNK4Q9NYG8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms