Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VNN3Q9NY84 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms