Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX18

SDHAF2, Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF2Q9NX18 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDHAF2Q9NX18 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF2Q9NX18 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms