Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GOPCQ9HD26 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GOPCQ9HD26 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GOPCQ9HD26 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GOPCQ9HD26 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GOPCQ9HD26 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GOPCQ9HD26 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GOPCQ9HD26 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GOPCQ9HD26 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GOPCQ9HD26 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GOPCQ9HD26 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GOPCQ9HD26 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GOPCQ9HD26 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GOPCQ9HD26 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GOPCQ9HD26 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GOPCQ9HD26 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GOPCQ9HD26 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GOPCQ9HD26 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms