Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMPQ9H6B4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms