Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms