Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFDQ9GZP0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms