Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms