Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
KRTAP2-4Q9BYR9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms