Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms