Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCP2Q9BX26 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms