Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC106Q9BWC9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms