Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM208Q9BTX3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
TMEM208Q9BTX3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM208Q9BTX3 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM208Q9BTX3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM208Q9BTX3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM208Q9BTX3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM208Q9BTX3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM208Q9BTX3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM208Q9BTX3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM208Q9BTX3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM208Q9BTX3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM208Q9BTX3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM208Q9BTX3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM208Q9BTX3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM208Q9BTX3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM208Q9BTX3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM208Q9BTX3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM208Q9BTX3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM208Q9BTX3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM208Q9BTX3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM208Q9BTX3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM208Q9BTX3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM208Q9BTX3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM208Q9BTX3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM208Q9BTX3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms