Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EBF4Q9BQW3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms