Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USB1Q9BQ65 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms