Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD5Q99666 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms