Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CICQ96RK0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms