Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms