Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms