Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms