Protein–RNA interactions for Protein: Q96N53

LINC00167, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00167, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00167Q96N53 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00167Q96N53 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms