Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms