Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms