Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms