Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms