Protein–RNA interactions for Protein: Q96I99

SUCLG2, Succinate--CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2Q96I99 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUCLG2Q96I99 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SUCLG2Q96I99 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUCLG2Q96I99 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUCLG2Q96I99 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUCLG2Q96I99 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUCLG2Q96I99 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SUCLG2Q96I99 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SUCLG2Q96I99 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCLG2Q96I99 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms