Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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FAM3DQ96BQ1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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FAM3DQ96BQ1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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FAM3DQ96BQ1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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FAM3DQ96BQ1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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FAM3DQ96BQ1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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FAM3DQ96BQ1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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FAM3DQ96BQ1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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FAM3DQ96BQ1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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