Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-CQ95604 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms