Protein–RNA interactions for Protein: Q93096

PTP4A1, Protein tyrosine phosphatase type IVA 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A1Q93096 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTP4A1Q93096 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A1Q93096 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A1Q93096 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A1Q93096 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A1Q93096 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms