Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms