Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms