Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GATAD2BQ8WXI9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms