Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX33Q8WV41 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms