Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUW1

BRK1, Protein BRICK1, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRK1Q8WUW1 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
BRK1Q8WUW1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms