Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms